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#Novedades de la industria
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Nuevo CRISPR-CAS, Gene Editing Systems, descubierto en grupo de datos extenso de las secuencias de ADN
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Los investigadores descubren el primer sistema CRISPR-Cas9 en el archaea, que puede permitir las nuevas tecnologías para la investigación biológica
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La ciencia
Conociendo el grado de la diversidad microbiana, especialmente el gen que corrige, puede ayudar a científicos a solucionar desafíos de la energía y de la limpieza. Usando una gran cantidad de datos genéticos, los investigadores analizaban 155 millones de genes de la proteína-codificación de comunidades microbianas incultas. Este trabajo llevó al descubrimiento de la primera proteína Cas9 de CRISPR- (agrupado interspaced regularmente repeticiones palindrómicas cortas) en el ámbito archaeal, grupo de la hermana a las bacterias. El equipo también encontró dos sistemas bacterianos simples previamente desconocidos de CRISPR-CAS. Un sistema de CRISPR-CAS utiliza las proteínas del Cas para corregir la DNA microbiana. El sistema de CRISPR-CAS es la base de las tecnologías que revolucionan la investigación. Hasta este estudio, los científicos sabían solamente de los sistemas de CRISPR-CAS en algunas bacterias aisladas, no el archaea unicelular; este hallazgo sugiere que CRISPR-CAS que corrige sistemas pueda ser mucho más extenso en naturaleza que creído previamente.
El impacto
Los microbios desempeñan los papeles dominantes en los ciclos del planeta. Caracterizar microbios ayuda a investigadores a trabajar hacia las soluciones para la energía y los desafíos ambientales. El examen de comunidades microbianas ambientales ha permitido el acceso a una diversidad sin precedente de genomas y de los sistemas de CRISPR-CAS. Los sistemas tienen usos incluyendo la investigación biológica. El acercamiento de cómputo-experimental combinado que era acertado en este estudio se puede utilizar para investigar casi todos los ambientes donde existe la vida.
Resumen
Los microbios influencian pesadamente los ciclos del planeta, pero solamente se ha identificado una fracción. Caracterizar el grado abundante pero en gran parte desconocido de la diversidad microbiana puede ayudar a investigadores a desarrollar soluciones a la energía y a los desafíos ambientales. En microbios, los sistemas de CRISPR-CAS proporcionan una forma de inmunidad adaptante, y estas herramientas gen-que corrigen son la fundación de las tecnologías versátiles que revolucionan la investigación. Hasta el momento, la tecnología de CRISPR-CAS se ha basado solamente en sistemas de bacterias aisladas. En un estudio el 9 de febrero publicado en naturaleza y llevado por Jill Banfield de la Universidad de California, Berkeley, investigadores descubrió, por primera vez, un sistema CRISPR-Cas9 en archaea. También descubrieron los sistemas simples de CRISPR-CAS en bacterias incultivables. Para identificar estos nuevos sistemas de CRISPR-CAS, el equipo aprovechó más que el valor de una década de datos metagenomic de las muestras ordenadas y analizadas por el Ministerio de los E.E.U.U. de Joint Genome Institute de la Energía (GAMA JGI), una oficina de la GAMA de la instalación del usuario de la ciencia. El equipo encontró las proteínas de CasX y de CasY en bacterias de muestras del agua subterránea y del sedimento. El Cas9 archaeal fue identificado en las muestras recogidas del sitio de Iron Mountain Superfund como parte del trabajo pionero del metagenomics de Banfield con la GAMA JGI. CasX y CasY están entre algunos de los sistemas más compactos identificaron nunca. Este uso del metagenomics valida estudios de las proteínas de CRISPR-CAS usando organismos vivos.