Tallar un lugar analítico by Joanna CummingsMedicalExpo

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#Personalidades

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Como parte de mi investigación de la química del estudiante, utilicé GC-MS y LC-MS para detectar los ácidos grasos en glaucoma. Era mi primera exposición a usar la espectrometría de masa para los usos biológicos – y yo fue excitado inmediatamente por las posibilidades. En Indiana University, elegí un proyecto de la disertación usando métodos analíticos de la espectrometría de masa para estudiar las proteínas y el envejecimiento en moscas del vinagre. Utilicé al movilidad-ms del ion, que añadió otra dimensionalidad a los datos, aumentando el espacio de la separación y permitiendo que vea más proteínas de la bajo-concentración. Era un proyecto de investigación muy interdisciplinario, colaborativo, y todo era nuevo a mí – de la genética de las moscas del vinagre a tamizar con cantidades masivas de datos del proteomics para conseguir algo significativo. Era emocionante trabajar en el campo en mediados de 2000 s, cuando el proteomics acababa de comenzar a convertirse en una gran cosa.

El campo se ha movido desde el establecimiento de métodos iniciales para medir las proteínas a la instrumentación de avance de una manera tal que permita que perfilemos proteomes enteros con sensibilidad increíble, para detectar diferencias en individuos enfermos y sanos. Hemos conseguido realmente buenos en rápidamente analizar los datos resultantes y centrarse en las implicaciones funcionales para las proteínas. La pregunta ahora está: ¿cómo podemos analizar redes dinámicas, y utilizamos la información espacial y temporal de la mejor manera de avanzar la investigación?

La colaboración con un colega que trabajaba en la enfermedad de Parkinson chispeó mi interés en las posibilidades de aplicar al ms en enfermedades relativas a la edad. Tengo conexiones personales a la enfermedad de Alzheimer (ANUNCIO), y quise cavar más profundo en los mecanismos detrás del neurodegeneration. Comencé a buscar las oportunidades postdoctorales donde podría centrarme más en la patología relativa a la edad. Un aspecto universal del envejecimiento es una disminución en el sistema inmune, que me llevó a centrarme mi trabajo en el papel del immunosenescence en enfermedad relativa a la edad.

Estamos utilizando la tecnología de Orbitrap – los espectrómetros de masas muy de alta resolución y sensibles – para realizar los experimentos de la multiplexación (ms, entonces MS/MS, y entonces MS/MS/MS) investigando cómo las proteínas cambian durante el envejecimiento y el immunosenescence, y buscando blancos potenciales de la droga en enfermedad neurodegenerative. Es trabajo emocionante – estamos viendo las cosas que nunca se han considerado antes. Por ejemplo, hemos podido determinar que el hígado desempeña un papel significativo en enfermedad de Alzheimer identificando muchas proteínas con diversa expresión en los modelos del ratón del ANUNCIO comparados a los salvaje-tipos. Además, hemos comenzado a entender mejor los efectos de la tensión oxidativa en el ANUNCIO midiendo nitratado y las proteínas de S-nitrosylated. Mientras que somos conscientes que el ANUNCIO es una enfermedad de cerebro, tenemos datos significativos del proteomics para mostrar que los órganos periféricos también tienen un papel importante. Nuestros proyectos actuales se adaptan hacia la comprensión de la naturaleza total del ANUNCIO y la determinación de si hay los sistemas que hacen ciertas poblaciones más en riesgo de ANUNCIO que se convierte.

Es un regalo y un privilegio hacer este tipo de investigación; Siento como esto soy mi propósito. El pensamiento de toda la gente que se está dejando devastada por el ANUNCIO me mantiene enfocado. Me recuerda que necesitamos apuntar para más que apenas las mejoras ampliadas en nuestra tecnología y acercamiento analítico – hay una imagen más grande que tenemos que tener presente.

Nuestro laboratorio se está moviendo a la universidad de Vanderbilt este verano. Hay porciones de oportunidades en Vanderbilt de hacer la espectrometría de masa realmente de primera calidad – y de involucrarse con la memoria y el centro de Alzheimer para ayudar a la investigación adicional en esta área. Podremos añadir a nuestro repertorio de acercamientos y de técnicas, y reforzamos nuestras plataformas totales y tecnologías de espec. Así como las proteínas, estamos interesados en lípidos de medición y otros metabilitos. El equipo tiene ya mucha experiencia analítica, pero estamos planeando ampliar nuestras capacidades en informática y biología funcional, para permitir que sigamos en nuestros hallazgos del proteomics. Nos excitan particularmente para tener más acceso a las muestras humanas en la clínica. En diez años, espero que hayamos podido ayudar a la investigación anticipada del ANUNCIO – y que seamos un paso más cercano a un tratamiento eficaz.

Era un punto culminante real, ser presentado especialmente el premio por Sarah Trimpin (ahora en Wayne State University). Sarah ha sido un mentor a mí desde que ella era un postdoc y yo era un estudiante del doctorado en Indiana. ¡Ella me mostró que cómo empujar lejos en un problema y darle todo que tengo! Ella trabaja extremadamente difícilmente y extremadamente elegante; no sólo ella ha hecho tanto con técnicas y espectrometría de masa de la ionización, pero ella también considera cada ángulo que usted podría abordar un problema particular. Ella ha tallado un lugar para sí misma, y me inspiró a que se preguntara, “qué va a ser mi cosa?”

Espero que pueda considerar detrás mi carrera y decir mi lugar era que desarrollaba y de aplicación de proteomics cuantitativo de una manera que ha fomentado nuestra comprensión del ANUNCIO y del envejecimiento – específicamente, cómo las cosas fuera del cerebro se relacionan con lo que está sucediendo en el cerebro. Desde el principio, sabía que quise adquirir un problema en salud humana, y que utilizo mi skillset analítico para ayudar a contestar a ese problema.