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#Novedades de la industria
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Una nueva manera de detectar cualquier virus humano
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Algunos virus, como Zika, pueden ser desafiadores estudiar cuando causan repentinamente brotes porque pueden ser duros detectar en muestras de sangre.
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Ahora, los científicos en el laboratorio de Pardis Sabeti en el instituto allí amplio han creado una manera de diseñar los cebos moleculares que pueden asir partículas virales. La nueva herramienta, llamó la CAPTURA, permitirá a investigadores estudiar los virus que están solamente presentes en los niveles bajos en muestras clínicas. El trabajo se ha divulgado en biotecnología de la naturaleza. Discussess de Sabeti cómo supervisamos y respondemos a los brotes de la enfermedad infecciosa en el vídeo. “Pues siente bien la secuencia genomic a una parte crítica de vigilancia de la enfermedad, las herramientas como CAPTURA nos ayudarán y otras detectan los brotes anteriores y generar más datos en los patógeno que pueden ser compartidos con las comunidades de investigación científica y médica más anchas,” dijo al autor co-mayor del estudio Christian Matranga, que ahora trabaja con un inicio de Biotech.
Las partículas virales se pueden capturar, incluso en los niveles bajos, con las técnicas metagenomic, que apuntan ordenar todo el material genético en una muestra. Pero esos virus de bajo nivel pueden conseguir perdidos en la enorme cantidad de información genética de otras fuentes, como microbios y la DNA del paciente.
Los científicos en el laboratorio de Sabeti necesitaron una manera de utilizar puntas de prueba que habían hecho ya para detectar pedazos de DNA viral, mientras que también enriquecían los microbios que estaban presentes en los niveles bajos, como Zika.
“Quisimos repensar cómo diseñábamos realmente las puntas de prueba para hacer captura,” dijimos al estudiante de tercer ciclo Hayden Metsky del MIT. “Realizamos que podríamos capturar virus, incluyendo su diversidad sabida, con menos puntas de prueba que nosotros habíamos utilizado antes. Para hacer esto una herramienta eficaz para la vigilancia, entonces decidíamos intentar apuntar cerca de 20 virus a la vez, y escalamos eventual hasta las 356 especies virales sabidas para infectar a seres humanos.”
Desarrollaron la CAPTURA (agregación compacta de las blancos para el hibridación completo), que permite a un usuario diseñar las puntas de prueba que asen el material genético de la especie microbiana, incluyendo los virus que infectan a gente. Las puntas de prueba se basan en cualquier virus humano que esté en la base de datos de GenBank (del centro nacional para la información de biotecnología) y pueda ser hecho por cualquier número de compañías comerciales de la punta de prueba-síntesis.
En este trabajo, los investigadores utilizaron la CAPTURA para diseñar las puntas de prueba para Zika y el chikungunya y podían detectar la presencia de virus de Zika en varias regiones antes de que otros científicos pudieran a. Esto demuestra que esta estrategia podría ayudar a controlar brotes en el futuro. Idealmente, este acercamiento sería utilizado en ubicaciones donde están comunes los brotes virales. “Quisiéramos que nuestros socios en Nigeria pudieran realizar eficientemente la secuencia metagenomic de muestras diversas, y las ayudas de la CAPTURA las de impulsar la sensibilidad para estos patógeno,” explicaron al investigador postdoctoral Katie Siddle.
El método puede también ayudar a los clínicos que encuentran las fiebres que se pueden causar por un virus, pero son difíciles de diagnosticar. “Nos excitan sobre el potencial para utilizar la secuencia metagenomic para verter la luz en esos casos y, particularmente, la posibilidad de hacer tan localmente en países afectados,” dijo a Siddle.
La CAPTURA puede también ser utilizada fácilmente cuando se descubren las nuevas secuencias virales. Las puntas de prueba diseñadas por Metsky y Siddle también se han hecho disponibles para el uso público.
Este trabajo puede no sólo mejorar nuestra capacidad de mirar para los brotes virales, pero podría también ayudar en estudios en grande de microbiomes o convertirse en una herramienta de diagnóstico.