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Pruebas genéticas: Nuevos recursos y desafíos

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Las nuevas pruebas están ampliando la utilidad del análisis genético y la están prometiendo simplificar el proceso de diagnóstico.

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¿Si usted? re buscando un ejemplo de la evolución rápida de la ciencia, parezca no más futuro que el campo de la genética. El conocimiento en esta área está estallando, y ése está traduciendo a un aumento constante en el uso de las pruebas genéticas en la diagnosis y la gerencia de la enfermedad. Aquí, los expertos en este campo discuten dos novedades importantes que afecten la oftalmología; proporcione una mirada en algunos de los recursos actuales disponibles a los médicos; y consejo de la oferta sobre cómo hacer la mayor parte de las estas herramientas.

Dos nuevas pruebas

Los investigadores en el instituto ocular de la genómica (asociado a la enfermería del ojo y del oído de Massachusetts y a la Facultad de Medicina de Harvard en Boston) han desarrollado CLIA-haber certificado, next-generation, gene-ordenando el protocolo diseñado para los pacientes con enfermedades de ojo heredadas, incluyendo glaucoma, degeneraciones retinianas y atrofia óptica. Las pruebas se refieren como los paneles genéticos de la enfermedad de ojo, o GEDi. La prueba de GEDi-R busca mutaciones referente a desordenes retinianos; la prueba de GEDi-O comprueba para saber si hay mutaciones referente atrofia óptica y a glaucoma temprano del inicio.

¿Los resultados de la prueba clínicos, divulgados en una publicación reciente, 1 han demostrado que el GEDi prueba? la capacidad de detectar una sola variante del nucleótido tiene una sensibilidad y una especificidad del 97.9 por ciento y del 100 por ciento, respectivamente. (El estudio es autor de la nota que éste compara favorable con la sensibilidad del 88.3 por ciento alcanzada por la secuencia entera-exome usando un sistema disponible en el comercio de la captura del exome; atribuyen esto para mejorar la cobertura de genes apuntados en las pruebas de GEDi.) La prueba anticipada de 192 pacientes con degeneraciones retinianas heredadas encontró que la prueba retiniana de GEDi tenía un índice de diagnóstico del 51 por ciento.

Estas pruebas se pueden pedir por un profesional médico; la vuelta es 90 días. La prueba retiniana cuesta $2.500; la prueba de la atrofia/del glaucoma cuesta $1.250. (El seguro médico puede cubrir la parte o todo el coste.)

Otro reciente desarrollo es una prueba avanzada referente a cataratas congénitas, una condición de la DNA que pueda ser un síntoma de más de 100 diversas enfermedades. La destapadura de las mutaciones que ligaban las cataratas congénitas a esas enfermedades era un proceso largo, costoso y no no totalmente confiable que implicaba pruebas genéticas múltiples y las pruebas no genéticas numerosas, dirigidas por antecedentes familiares detallados. Ahora, los investigadores en la universidad de Manchester en Inglaterra han desarrollado una prueba usando una nueva tecnología de DNA-secuencia llamada la secuencia next-generation, o NGS. Las nuevas miradas de la prueba en 115 genes sabidos para ser asociado a las cataratas congénitas y pueden encontrar mutaciones conectadas con una de esas enfermedades dentro de algunas semanas. (La nueva prueba también ha destapado las mutaciones relacionadas con la condición que no eran sabidas previamente.)

Un estudio que determinaba la eficacia de la prueba, publicada recientemente en oftalmología, 2 implicó a 36 pacientes diagnosticados con la catarata congénita bilateral (nonsyndromic o syndromic) y un grupo de control. La prueba podía determinar la causa genética de la catarata congénita en el 75 por ciento de los temas. Además, el 85 por ciento de pacientes con el cc nonsyndromic tenía probables mutaciones patógenas.

¿? La catarata congénita es una condición difícil a diagnosticar genético; ¿más de 100 genes se han asociado a ella? observa a Raquel Gillespie, que diseñó la nueva prueba y es autor importante del estudio. ¿? Importantemente, las cataratas en niños y los bebés pueden presentar como problema aislado o como indicación temprana de una condición subyacente del multisistema. Sin embargo, las presentaciones clínicas en niños y niños jovenes pueden ser muy suaves y ambiguas, así que la delineación de la causa exacta es casi imposible. [Al mismo tiempo,] la diagnosis pronto de estas condiciones es imprescindible de modo que la supervisión preventiva temprana del tratamiento y/o de la enfermedad pueda comenzar cuanto antes.

¿? ¿Los métodos tradicionales de las pruebas genéticas requerirían la investigación de genes catarata-que causan individualmente y encontrarían consecutivamente la causa? ¿un proceso que puede tardar un tiempo muy largo y es a menudo fracasado? ella continúa. ¿? Nuestra prueba defiende 115 genes de la catarata simultáneamente de una sola pequeña muestra de la sangre o de la saliva, haciendo diagnosis mucho más fácil y más eficiente. Hemos visto una tarifa muy alta de la diagnosis: Nuestra prueba puede encontrar la causa probable en el cerca de 75 por ciento de todos los pacientes probada. Interesante, para un número de niños, nuestros resultados genéticos han permitido una diagnosis de condiciones específicas, alterando su gerencia y tratamiento clínicos. Además, la identificación de la causa genética de la catarata congénita dentro de las familias permite el asesoramiento para el pronóstico, el riesgo a otros miembros de familia y el consejo sobre la prueba prenatal en los embarazos futuros.

¿? ¿Por ejemplo, una familia que trabajamos con tenido tres miembros? ¿dos hermanos y su primo? ¿quién presentó con las cataratas del niñez-inicio, los asimientos y comportamiento desafiador con las características autísticas que parecían empeorar con edad? ella dice. ¿? Tenían cada pruebas numerosas experimentadas para intentar y para determinar la causa, y a pesar de resultados adicionales del myelination retrasado de una exploración de MRI, una diagnosis exacta no fue hecha. La investigación genética de NGS identificó una mutación en el gene CYP27A1 que se sabe para causar xanthomatosis cerebrotendinous, un desorden del lípido-almacenaje que puede ser fatal; confirmamos esta mutación como patógena perfilando del lípido. CTX es muy suave en infancia (las presentaciones iniciales son catarata y diarrea), pero llega a ser mucho más serio con edad. La diagnosis temprana es crucial porque el tratamiento preventivo está disponible bajo la forma de ácido y statins quenodeoxicólicos, que pueden prevenir la progresión de la enfermedad pero no puede invertirla después. ¿Afortunadamente, podíamos diagnosticar esta condición relativamente temprano en esta familia y son todos que hacen bien en el tratamiento.?

¿Ms Gillespie los dice? VE que trabaja difícilmente en esta nueva tecnología. ¿? ¿Nosotros? ¿re actualmente investigando el impacto que esta prueba está teniendo en el cuidado de los pacientes congénitos de la catarata? ella dice. ¿? La prueba ha estado disponible en el Reino Unido desde el diciembre de 2013, y puede ser pedida por las instalaciones médicas registradas vía la remisión internacional sobre (algo que la investigación) una base de diagnóstico. La información de remisión se puede encontrar en mangen.co.uk, junto con criterios de la muestra. ¿Para conducir la prueba que pedimos un mínimo de 1 ml de sangre en el EDTA (ácido etilendiaminotetracético), o el µg 10 de la DNA de alta calidad.?

Haciendo la prueba accesible

Otro laboratorio que hace el trabajo notable es el Juan y el laboratorio no lucrativo de las pruebas genéticas de Marcia Carver, afiliado con la universidad de Iowa. El laboratorio, dirigido por la piedra de Edwin M., MD, PhD, y Val C. Sheffield, MD, PhD, se dedica a proporcionar las pruebas genéticas no lucrativas para las enfermedades de ojo raras. Las pruebas ofrecen incorporado la investigación hecha por la DRS. La piedra y Sheffield, así que las pruebas proporcionan lo más clínico posible la información relevante mientras que sigue siendo comprables.

¿? ¿Cuándo comencé a trabajar para el Carver que el laboratorio allí era probablemente 20 genes heredados de la enfermedad de ojo sabidos? ¿dice el laboratorio? s Jean Andorf. ¿? Ahora hay más de 250. El campo ha crecido tan rápidamente, y nuestra prueba ha crecido con esa tarifa del descubrimiento del gene. ¿Nos motivaron para ofrecer estos servicios porque una vez que un gene se ha encontrado y se ha estudiado durante mucho tiempo usted puede? dinero de la concesión de la toma de t con el fin de genotyping a más familias. ¿Así pues, todos estos dólares de la investigación irían a descubrir un gene, y entonces el wouldn de las pruebas genéticas? t esté disponible para los pacientes. ¿Nuestra meta era? ¿y sigue siendo? para ofrecer pruebas genéticas comprables a cualquier persona que las quiere. Qué cargamos para una prueba es verdad apenas el coste de los técnicos de laboratorio y de los reactivo.

¿? ¿Somos también un laboratorio de investigación? ella continúa. ¿? Sobre un tercero de nuestro esfuerzo se centra en pruebas genéticas no lucrativas; y cerca de dos tercios está en la investigación. ¿Nosotros? re nuevos genes constantemente que buscan, así como maneras de entender mejor los genes se saben que. ¿Por ejemplo, uno de nuestros biólogos, Budd Tucker, PhD, es la fabricación pasos grandes enormes al usar las células de vástago pluripotent para tratar a gente con enfermedades de ojo heredadas.?

¿Uno de los proyectos en curso en el laboratorio de Carver se refiere como? ¿Proyecto 3.000? ¿un esfuerzo para identificar a cada persona en los Estados Unidos que sufren de Leber? ¿amaurosis congénito de s? estimado para ser cerca de 3.000 en gran número. ¿? ¿Este programa ha permitido que ofrezcamos pruebas genéticas a estos individuos y ha poblado un número de los ensayos del tratamiento RPE65, mientras que proporciona una población significativa para la investigación clínica futura en pronóstico de largo plazo? dice a ms Andorf. ¿? ¿Además de encontrar la mayor parte de a los pacientes de LCA bajo edad de 20, nosotros? VE también identificó a un puñado de una más vieja gente con la enfermedad. ¿Un cierto didn? t realiza que ella tenía esta enfermedad; muchas eran simplemente persianas llevadas durante una era en que poco era sabida sobre enfermedades de ojo heredadas. Muchos de estos adultos son cognoscitivo normales con alta inteligencia y el funcionamiento muy bien. Eso nos permite dar esperanza a las familias con un niño que comparte esa causa genética particular. ¿Usted puede decir? ¿Tengo un paciente de 70 años que acaba de multar en su vida que tiene el mismo tipo de mutación genética que su niño.? ¿Esa clase de información es enorme beneficiosa para una familia, incluso si él doesn? ¿t les trae el tratamiento hoy.?

Fabricación la mayor parte de de la prueba

Ms Andorf ofrece varias sugerencias con respecto a pruebas genéticas:

¿? Su paciente puede no necesitar la prueba completa del exome. ¿? ¿Los gracias a la existencia del exome que ordena, muchos laboratorios simplemente le darán todos los datos que encuentran? ella observa. ¿? Sin embargo, hay varias enfermedades que son causadas por un pequeño gene o apenas algunos genes. Un exome entero cuesta vario mil dólares, mientras que una prueba para esa una mutación puede costar a un par cientos dólares. ¿Mientras que el exome que ordena ciertamente tiene un lugar en las pruebas genéticas para las enfermedades de ojo heredadas, él? ¿s no un buen uso de cualquier persona? ¿recursos de s para hacer un exome completo que ordena para una persona con una enfermedad monogenic.?

Ms Andorf dice muchos resultados de la prueba innecesarios de los médicos que no confían en su propia diagnosis. ¿? ¿Quisiéramos realmente que los doctores pidieran la prueba correcta? ella dice. ¿? ¿Él? ¿s no bueno para nosotros si un doctor pide pruebas múltiples en nuestro Web site para un paciente porque él? s que intenta encontrar una diagnosis. Los doctores han estado viendo la mayor parte de a estos pacientes durante mucho tiempo; ¿necesitan confiar en su maestría clínica para intentar emparejar al paciente? resultados clínicos de s con la prueba apropiada. Nuestra meta no es diagnosticar al paciente con la prueba; nuestra meta es confirmar la diagnosis. ¿De hecho, nosotros? ¿re funcionamiento en la distribución de la información clínica con los médicos que les ayudarán para enangostar abajo la prueba para sus pacientes.?

Ms Andorf dice que por esta razón, defienden a menudo a los pacientes que tienen enfermedades heterogéneas en gradas. ¿? ¿Comenzamos probando para la mutación genética más probable? ella explica. ¿? En un porcentaje significativo de pacientes identificamos la mutación con una prueba sola, barata usando este protocolo. ¿La otra ventaja de este acercamiento? ¿para cuál alguna gente nos critica? es eso que un exome completo revela mucha información inaplicable que pueda nublarse una diagnosis. Defendemos el gene más constante con sus características clínicas.

¿? ¿Él? ¿s aún más importante tener una diagnosis eso? ¿s tan exacto como sea posible al perseguir el exome que ordena? ella agrega. ¿? En promedio, la secuencia del exome revelará mutaciones enfermedad-que causan muy plausibles en ocho genes heredados sabidos de la enfermedad de ojo. Así, los pacientes con diagnosis inexactas tendrán a menudo resultados engañosos en los genes constantes con la diagnosis inexacta. ¿Nosotros? casos vistos VE en los cuales han engañado a las familias y a los médicos debido a este tipo de situación. ¿Demasiada información genética puede hacer los resultados más duros interpretar.?

¿? Cerciórese de que el paciente esté consultando con un consejero genético. ¿? ¿Porciones de email de los pacientes nosotros informes que consiguieron de otro laboratorio? ¿una lista de mutaciones sin la interpretación de los resultados? dice a ms Andorf. ¿? Aquí, trabajamos con un especialista heredado de la enfermedad de ojo que se ha ocupado de la enfermedad de ojo heredada por más de 25 años. ¿Cualquier enfermedad usted? ¿el re tratar de, nosotros? VE defendió probablemente millares de otros con la misma enfermedad. Tener la capacidad de ver correlaciones clínicas a los resultados de la prueba genéticos le da un de alto nivel de la confianza en la interpretación y reduce al mínimo la información que puede ser confusa.

¿? ¿Por esa razón, el médico que pide una prueba de nosotros tiene que anotar quién está proporcionando el asesoramiento genético al paciente? ella dice. ¿? Los pacientes quisieran a menudo que les enviáramos el informe directamente. ¿Decimos? ¿Si su doctor pidió una prueba de función de riñón para usted, el wouldn del laboratorio? t le envía los resultados directamente. ¿Usted necesita realmente tener un médico y un consejero genético para poder entender estos datos.? ¿Intentamos conseguir el médico y a la familia pensar en eso antes de la prueba.?

¿? El tiempo de vuelta no debe ser su solamente consideración. ¿? ¿Nos critican a veces por nuestros tiempos largos de vuelta? ms Andorf de las notas. ¿? ¿Eso? s verdad en algunos casos, pero nosotros agrupa a pacientes juntos para mantener los costes tan bajos como sea posible. ¿Y nosotros? re no apenas un laboratorio clínico. ¿Algunos servicios ofrecerán un exome completo que ordena en el plazo de cuatro semanas, pero creemos que tiene más sentido de pedir una prueba específica eso? ¿s conforme a su propia diagnosis, incluso si dura para recibir los resultados.?

Localización de recursos

Como el número de aumentos disponibles de las pruebas, junto con el número de laboratorios que ofrecían las pruebas, la necesidad de una cámara de compensación central se ha puesto de manifiesto. Una compañía que intenta encontrarse que la necesidad es GeneTests,

basado en el parque de Elmwood, New Jersey. Su misión es promover el uso apropiado de las pruebas genéticas proporcionando la corriente, fácil-a-acceso, información libre sobre disponibilidad de la prueba.

¿Según Deborah L. Eunpu, encargado en la compañía, las pruebas genéticas lo más comúnmente posible pedidas referentes a enfermedad de ojo incluyen las pruebas para Leber? amaurosis congénito de s; atrofia óptica; pigmentosa de la retinitis; retinoblastoma; degeneración macular relativa a la edad; albinismo oculocutaneous; cataratas congénitas; glaucoma congénito; malformaciones del ojo (e.g., aniridia, microphthalmia, anophthalmia); y lente dislocada. Ms Eunpu dice que una vez que un cirujano ha encontrado un laboratorio que ofrece los servicios en los cuales el cirujano está interesado, él puede entrar en contacto con el laboratorio directamente.

¿? Muchos resultados de la prueba innecesarios de los médicos que no confían en su propia diagnosis. ¿Nuestra meta no es diagnosticar el paciente… [pero] para confirmar la diagnosis.?

¿? Jean Andorf

¿? ¿En nuestro Web site, una vez que se selecciona una prueba, la información sobre el laboratorio se puede alcanzar vía la información enumerada con la prueba? ella explica. ¿? Algunos laboratorios incluyen acoplamientos a su página de la prueba o las formas de demanda que pueden ser transferidas. Pedimos los laboratorios para proporcionar tiempos de vuelta, y están a menudo disponibles en la página de la información de la prueba. ¿Algunas pruebas pueden tomar menos que una semana? ¿por ejemplo, algunas pruebas bioquímicas, o hibridación in situ de la fluorescencia [una prueba que permite la visualización y el trazado del material genético en un individuo? ¿células de s]? pero otros, tales como exome completo que ordena, pueden tomar hasta 16 semanas. ¿La tecnología determina el tiempo que la prueba lleva.?

Ms Eunpu observa que el uso de la prueba está aumentando, y las opciones para la prueba continúan ampliándose. ¿? ¿En el último año nosotros? ¿VE agregó casi 10.000 nuevas pruebas, muchas debido a las nuevas tecnologías? ella dice. ¿? Por ejemplo, la disponibilidad de la secuencia next-generation ha abierto la puerta en los genes múltiples de la prueba a la vez. Estas pruebas pueden ser las más provechosas si uno no está seguro para el cual de varias condiciones relacionadas a probar. ¿Sin embargo, cuando se sospecha una diagnosis específica, un solo gene se puede interrogar.?

Ms Eunpu espera ver aún más nuevas pruebas y uso creciente. ¿? ¿La genética continúa siendo una excitación, desarrollando el campo en el cual los avances en tecnología y conocimiento pueden llevar a los cambios rápidos? ella dice. ¿? ¿Cada uno tiene por completo secuencia? No probablemente. Pero como más tratamientos se basan en saber la mutación genética específica, las razones para hacer muchas pruebas obligarán. Con ensayos clínicos y oportunidades para la visión mejorada el surgimiento con tratamientos emergentes, probando se está mirando mucho diferentemente. ¿Ahora la prueba puede llevar a los tratamientos específicos.?