El D3 Array™ está llenando los vacíos dejados por la NGS y la qPCR

PathogenDx se expande a los laboratorios clínicos, ofreciendo pruebas multiplex de bajo coste con el D3 Array™

Desde la llegada de los microscopios hasta la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa (qPCR) y la secuenciación de nueva generación (NGS), los laboratorios clínicos están más capacitados que nunca para realizar pruebas diagnósticas eficaces. Sin embargo, ni siquiera las potentes herramientas de diagnóstico actuales pueden hacerlo todo: siguen siendo necesarios nuevos avances para agilizar y mejorar las pruebas clínicas.

Allí donde la qPCR y la NGS se quedan cortas, PathogenDx trata de suplir esta carencia abordando los retos de rendimiento, producción y coste en relación con las pruebas multiplex con la expansión de su plataforma D3 Array™.

El nuevo D3 Array™ ampliado

Originalmente desarrollada para el sector del cannabis, los investigadores de PathogenDx sabían que su matriz era capaz de mucho más y pusieron sus miras en la industria clínica. Al principio resultó difícil entrar en estos sectores, ya que uno de los grandes puntos fuertes del D3 Array™ es su capacidad para analizar casi 100 objetivos por triplicado en un tiempo relativamente corto, lo que lo hace ideal para el análisis de variantes, algo que antes no se consideraba necesario.

"El gobierno y los médicos dirían que no hay utilidad clínica en las pruebas de variantes", afirma Milan Patel, director general y cofundador de PathogenDx, que habló recientemente con Lab Manager. Sin embargo, cuando el mundo se vio afectado por el COVID-19, la demanda de pruebas rápidas de variantes aumentó drásticamente. "Podíamos detectar [usando el D3 Array™] no solo el SARS-CoV-2, sino variantes que eran importantes desde una perspectiva clínica"

Al demostrar la utilidad del D3 Array™ durante el punto álgido de la pandemia, PathogenDx había posicionado su matriz para situarse junto a herramientas de diagnóstico como la qPCR y la NGS en el sector clínico. "La siguiente progresión natural con el uso de nuestra tecnología es en el ámbito de las enfermedades infecciosas", afirma.

Patel y los desarrolladores del D3 Array™ también se dieron cuenta de que esta forma de análisis no era de valor exclusivo para el diagnóstico humano, sino que también podía utilizarse en los sectores alimentario y agrícola. La Salmonella, por ejemplo, también tiene variantes que causan infecciones, por lo que PathogenDx creó un ensayo de serotipado de Salmonella para el D3 Array™ que evalúa 13 subespecies diferentes de Salmonella en la misma prueba.

La capacidad de pasar rápidamente a estos otros sectores es otro punto fuerte del D3 Array™, que está altamente estandarizado en diferentes laboratorios. "La matriz no difiere de lo que se ve en una matriz de pruebas de cannabis, de una matriz clínica o de una matriz alimentaria. Es la misma matriz. Si se analiza la E. Coli en el cannabis, y si se analiza la E. Coli en un panel GI para análisis clínicos o la E. Coli en alimentos, se trata exactamente de la misma matriz: los cebadores y las sondas son los mismos", afirma Patel. "Esa es la belleza de la tecnología"

Rápida, asequible y precisa

Aunque la qPCR y la NGS son herramientas potentes y útiles, sigue habiendo lagunas en el mercado de las pruebas de diagnóstico. En el caso de la qPCR, las pruebas multiplexadas suelen tener un rendimiento limitado, mientras que la NGS, cuyo rendimiento es aún menor, tarda mucho tiempo en realizarse y su coste es prohibitivo. Para dar respuesta a estos problemas, el D3 Array™ ofrece un alto rendimiento y velocidad, además de ser una opción mucho más rentable para los laboratorios de diagnóstico.

"Lo mejor del [D3 Array™] es que cuesta una fracción de lo que cuesta la secuenciación de nueva generación, ofrece el mismo nivel de capacidad de multiplexación que la secuenciación de nueva generación y supera todo lo que puede hacer la qPCR", afirma Patel. Mientras que la NGS puede tardar semanas en ofrecer resultados, el D3 Array™ sólo tarda días, lo que significa que los médicos pueden elaborar planes de tratamiento más rápidamente y ofrecer una medicina de precisión más eficiente y rentable, afirma.

ITU y más allá

PathogenDx tiene la intención de seguir ampliando el uso del D3 Array™ en otras áreas clínicas que utilizan pruebas multiplex, como el diagnóstico de infecciones del tracto urinario y la resistencia a los antibióticos frente a patógenos causantes de infecciones, con aplicaciones potenciales en el diagnóstico del cáncer y la salud de la mujer. El D3 Array™ también puede tener aplicaciones potenciales en telesalud y pruebas diagnósticas a domicilio en determinados casos de uso, como las ITS.

Independientemente de lo que nos depare el futuro, las mentes de PathogenDx confían en que el D3 Array™ liderará el avance hacia mejores diagnósticos para proporcionar a los médicos información más procesable para el diagnóstico y el tratamiento, así como pruebas multiplex mejores y más rentables. "Hay cuestiones con respecto a [qPCR y NGS] que esta tecnología de microarrays D3 Array™ en particular aborda por completo en términos de lo que el mercado necesita", dice Patel, "ya se trate de enfermedades infecciosas en el área de diagnóstico molecular u otras aplicaciones de multiplexación."