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DNA que ordena para mejorar el tratamiento de infecciones urinarias

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Las infecciones de zona urinaria (UTIs) se podrían tratar más rápidamente y eficientemente usando una DNA que ordenaba el dispositivo el tamaño de un palillo del USB - según la investigación de la universidad de East Anglia.

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Los investigadores utilizaron un nuevo dispositivo llamado MinION para realizar el nanopore que ordenaba para caracterizar bacterias de muestras de orina cuatro veces más rápidamente que usando métodos tradicionales de cultivar bacterias.

El nuevo método puede también detectar resistencia antibiótico - permitiendo que traten a los pacientes más con eficacia y mejorando la administración de disminuir reservas antibióticos.

Los resultados serán revelados hoy en una conferencia médica de cuatro días internacional en San Diego, funcionamiento en común por la sociedad americana para la conferencia de Interscience de la microbiología de los agentes antimicrobianos y de la quimioterapia (ICAAC) y la sociedad internacional de la quimioterapia (ICC).

Profesor David Livermore, de la Facultad de Medicina de Norwich de UEA, dijo: Las “infecciones de zona urinaria están entre las razones mas comunes de antibióticos que prescriben. La mayoría son suaves y afectan solamente a la zona urinaria más baja, pero algunos son más molestos. Este causa “ascendente” de UTIs una carga cada vez mayor de hospitalizaciones, sobre todo de pacientes mayores.

“En peor de los casos, la infección se derrama en la circulación sanguínea, llevando a una condición llamada el urosepsis, que puede ser fatal. Había más de 30.000 casos de infección de la circulación sanguínea de Escherichia Coli registrada en Inglaterra en 2014, sobre todo con un origen urinario.

Los “antibióticos son vitales, especialmente si las bacterias han entrado en la circulación sanguínea, y se deben dar urgente. Pero desafortunadamente tarda dos días para crecer las bacterias en el laboratorio y para probar que los antibióticos las matan.

“Consecuentemente, los doctores deben prescribir los antibióticos amplios de una gama, apuntando las bacterias muy probablemente para ser responsables, y después ajustan el tratamiento una vez que llegan los resultados del laboratorio.

“Esto significa que sobre-tratan a algunos pacientes, que por supuesto contribuye al problema de la resistencia antibiótico. Pero también significa que va un número creciente de pacientes con las bacterias que es resistente incluso a una gama amplia de drogas, undertreated. A veces esto puede ser fatal.

“Este “acercamiento del alfombra-bombardeo” representa la administración antibiótico pobre, y es vital que nos movemos más allá de él. La manera de hacer tan mentiras en la investigación de aceleración del laboratorio, para poder refinar tratamiento anterior, beneficiando al paciente, que consigue un antibiótico eficaz, y a la sociedad, cuya acción de disminución de antibióticos se maneja mejor.”

El equipo de investigación utilizó una nueva pequeña DNA que ordenaba al subordinado llamado dispositivo de Nanopore de las tecnologías de Oxford Nanopore para investigar UTIs rápidamente - sin cultivar las bacterias.

El Dr. Justin O'Grady, también de la Facultad de Medicina de Norwich de UEA, dijo: “Encontramos que este dispositivo, que es el tamaño de un palillo del USB, podría detectar las bacterias en orina pesadamente infectada - y proporcionar su secuencia de la DNA sobre apenas 12 horas. Éste es un cuarto de la época necesaria para la microbiología convencional.

“El tipo de bacterias y sus genes de resistencia adquiridos fueron identificados confiablemente, conviniendo con los perfiles de la resistencia encontrados por la prueba de laboratorio convencional.

Los “resultados rápidos como éstos permitirán refinar el tratamiento de un paciente mucho anterior - y eso es bueno para el paciente, que consigue antibiótico “derecho el”, y para la sociedad - que puede manejar mejor o “administrador” su fuente limitada de antibióticos.

“Esta tecnología es rápida y capaz no sólo de identificar las bacterias en UTIs, pero también de detectar droga-resistencia actualmente necesidad clínica.

“Todavía hay desafíos que se superarán. El acercamiento best suited actualmente a los casos difíciles, mientras que mejora la administración antibiótico de los hospitales requiere nuevos diagnósticos ser desplegado extensamente.

“Nuestro método trabaja actualmente solamente con orina pesado-infectada y no puede todavía predecir esas resistencias que se presenten por la mutación - cambios a los genes existentes - algo que la adquisición de los nuevos genes de resistencia. No obstante la tecnología se está convirtiendo rápidamente, con mejoras progresivas incluso durante nuestros estudios, y ella es probable que estas limitaciones puedan ser superadas.

“Es crucial que las superamos, porque el viejo acercamiento de usar una gama siempre más amplia de antibióticos es no más viable, dado la escasez de nuevas drogas, y la diversidad y la complejidad cada vez mayor de bacterias resistentes a los antibióticos” que él agregó.

Katarzyna Schmidt y el Dr. Justin O'Grady presentará el “subordinado Nanopore que ordena para identificar patógeno y genes de resistencia directamente de especímenes de orina” el 19 de septiembre en ICAAC/ICC 2015.