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El nuevo método de disco permite a la secuenciación unicelular scrna SEQ procesar muestras de forma eficaz con menos células
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El nuevo método de disco permite a la secuenciación unicelular scrna SEQ procesar muestras de forma eficaz con menos células
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La secuenciación de ARN unicelular, o scrna SEQ para abreviar, es una tecnología que permite a los científicos estudiar la expresión génica en células individuales de una población mixta, que es la forma en que existen todas las células en los tejidos humanos.
Como parte de la gran familia de la tecnología de secuenciación unicelular, la scrna SEQ consiste en capturar el ARN de una sola célula y secuenciarlo tras múltiples reacciones de transformación molecular. Dado que el ARN es un paso intermedio entre los genes del ADN y las proteínas, proporciona una descripción de qué genes están activos y cuáles no en una célula concreta.
Dado que la SEQ scrna capta la actividad de todos los genes del genoma celular y captura miles de genes a la vez, se ha convertido en el patrón oro para definir el estado y el fenotipo celular. Estos datos pueden revelar tipos celulares raros en poblaciones celulares, incluso tipos nunca vistos antes.
Pero scrna SEQ no es sólo una herramienta para la biología celular básica; se utiliza ampliamente en la investigación médica y farmacológica porque puede identificar qué células del tejido se están dividiendo activamente, o qué células responden a fármacos o tratamientos específicos.
Estos métodos unicelulares han cambiado nuestra capacidad de analizar las características de las células entre sistemas.
Sin embargo, el problema con el que se encuentran los investigadores es que scrna SEQ está actualmente adaptado para la entrada de grandes unidades.
No se trata de un problema menor, ya que el método scrna SEQ requiere más de 1000 células para realizar mediciones útiles. Esto hace que sea ineficaz y caro procesar pequeñas muestras individuales (como tejidos pequeños o biopsias de pacientes). A menudo, estas muestras deben resolverse cargando un gran número de muestras, lo que da lugar a lecturas caóticas de poblaciones celulares en mosaico.
La solución del disco
Bues, investigador del Instituto Federal Suizo de Tecnología EPFL, y un equipo formado por Marjan bio č anin y Joern pezoldt han desarrollado ahora un nuevo método que permite a scrna SEQ procesar muestras de forma eficaz con menos células. Este método, publicado en el Journal of natural methods, se denomina disco, deterministic, mRNA capture bed and cell co encapsulation dropping system.
